铁死亡实验设计没思路?看完这篇9分+文献解读就有了!

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铁死亡(ferroptosis)是一种铁依赖的、脂质过氧化物累积的新型细胞死亡方式,与肿瘤的发生、发展和耐药密切相关。自从铁死亡被发现以来,就以一己之力掀起研究狂潮,至今热度不减,俨然成为医学科研领域热门的研究方向,也是近些年国自然基金热点资助项目。

今天,小薇跟大家分享一篇“9+”铁死亡文献思路,手把手教你铁死亡实验设计。

文献信息

文章题目:Cetuximab promotes RSL3-induced ferroptosis by suppressing the Nrf2/HO-1 signalling pathway in KRAS mutant colorectal cancer(在KRAS突变型结直肠癌中,西妥昔单抗通过抑制Nrf2/HO-1信号通路促进RSL3诱导的铁死亡)

杂志:Cell Death and Disease (IF: 9.865)

研究设计

1. 研究西妥昔单抗对RSL3对KRAS突变CRC细胞的细胞毒作用的影响

使用4个KRAS突变的CRC细胞株(HCT116、DLD-1、LOVO和SW480)分别用RSL3单独或联合西妥昔单抗处理24小时,研究药物对细胞存活率的影响。通过存活率结果,后续实验选择HCT116和DLD-1细胞。研究RSL3、西妥昔单抗和二者联合处理24小时后对两种细胞存活率、细胞形态改变、集落形成能力等的影响。

2. 研究西妥昔单抗对KRAS突变CRC细胞中RSL3诱导的铁死亡的影响

为了研究RSL3和西妥昔单抗是否会促进铁死亡,在KRAS突变体HCT116和DLD-1细胞中评估了铁死亡相关指标,即脂质活性氧(ROS)积累、丙二醛(MDA)水平,细胞内的铁水平等。而且,细胞内加入铁死亡抑制剂Fer-1、凋亡抑制剂Z-VAD-FMK、坏死抑制剂necrostatin-1或自噬抑制剂3-MA,研究哪种抑制剂可以抑制RSL3和西妥昔单抗处理对HCT116和DLD-1细胞生长的抑制。

3. 研究RSL3和西妥昔单抗联合处理对KRAS突变CRC细胞中的Nrf2/HO-1轴的影响

Keap1是细胞对氧化应激反应的主要调节因子。氧化应激后,Keap1与Nrf2分离,导致Nrf2积累,核易位,激活靶基因HO-1的转录。因此,本研究首先研究了RSL3和西妥昔单抗联合处理对Keap1、Nrf2、HO-1等蛋白的影响;然后敲除Nrf2,评估Nrf2表达对西妥昔单抗和RSL3处理KRAS突变CRC细胞的存活率以及铁死亡相关指标的影响。

4. 研究西妥昔单抗是否通过激活p38 MAPK调节Nrf2/HO-1轴

为了研究p38 MAPK在Nrf2/HO-1表达中的作用,评估了西妥昔单抗和SB202190 (p38的特异性抑制剂)对HCT116和DLD-1细胞中p38活性、Nrf2和HO-1表达的影响;研究RSL3、西妥昔单抗和SB202190处理对细胞存活率的影响。然后,在两种细胞中过表达Nrf2或HO-1,研究过表达Nrf2或HO-1后对西妥昔单抗和RSL3联合处理的细胞的存活率的影响。

5. 体内试验研究西妥昔单抗在体内是否能促进RSL3诱导的铁死亡

构建异种移植裸鼠模型,探讨西妥昔单抗在体内是否能促进RSL3诱导的铁死亡。研究RSL3、西妥昔单抗及二者联合处理对肿瘤重量、肿瘤大小、肿瘤体积、体重;体内MDA水平;以及Nrf2、HO-1和Keap1蛋白水平的影响。

主要结果

1. 西妥昔单抗增强RSL3处理对KRAS突变CRC细胞的细胞毒性作用

研究发现,西妥昔单抗处理增强了RSL3对HCT116和DLD-1细胞的细胞毒作用(图1A,B)。与RSL3或西妥昔单抗处理相比,RSL3和西妥昔单抗联合处理显著抑制了细胞增殖(图1C)。提示西妥昔单抗处理通过显著抑制细胞活力、抑制细胞增殖,增强RSL3对KRAS突变CRC细胞系的细胞毒作用。

图1 西妥昔单抗增强RSL3对KRAS突变CRC细胞的细胞毒作用

2. 西妥昔单抗增强KRAS突变CRC细胞中RSL3诱导的铁死亡

采用脂质过氧化探针C11-BODIPY581/591检测细胞内脂质ROS水平,发现RSL3和西妥昔单抗联合处理后,脂质ROS积累显著增加(图2A)、MDA水平显著升高(图2B)。西妥昔单抗对HCT116或DLD-1细胞系的脂质ROS积累和MDA水平没有影响,但增强了RSL3诱导的脂质ROS水平和MDA水平的增加(图2B)。而且,与RSL3单独处理相比,RSL3和西妥昔单抗联合处理的细胞发出更强的橙色荧光(图2C)。此外,RSL3和西妥昔单抗处理增加了对HCT116和DLD-1细胞生长的抑制,这种效果被铁死亡抑制剂Fer-1逆转(图2D)。这些结果表明,西妥昔单抗能增强KRAS突变CRC细胞系中RSL3诱导的铁死亡。

图2西妥昔单抗治疗可增强KRAS突变CRC细胞中RSL3诱导的铁死亡

3. RSL3和西妥昔单抗联合处理可抑制KRAS突变CRC细胞中的Nrf2/HO-1轴

Western blot分析显示,RSL3和西妥昔单抗处理后,Keap1表达增加,抑制Nrf2/HO-1信号转导(图3A)。在HCT116和DLD-1细胞中,siRNA转染48 h可降低Nrf2及其下游靶点HO-1的表达。与RSL3组相比,RSL3处理的转染组中Nrf2和HO-1水平降低(图3B)。转染靶向Nrf2的siRNA可以提高HCT116和DLD-1细胞对RSL3的敏感性(图3C)。而且,Nrf2敲低提高了RSL3诱导的MDA水平(图3D)、细胞内脂质ROS水平(图3E)和细胞内铁积累(图3F)。这些结果表明,RSL3和西妥昔单抗联合处理可抑制KRAS突变CRC细胞中的Nrf2/HO-1信号。

图3 RSL3和西妥昔单抗联合处理可抑制KRAS突变CRC细胞中的Nrf2/HO-1轴

4. 西妥昔单抗激活p38 MAPK并调节Nrf2/HO-1轴

西妥昔单抗或SB202190处理的细胞中p38蛋白水平与对照组无差异。西妥昔单抗显著提高p-p38水平,但当西妥昔单抗与SB202190联合处理时,这种作用被消除(图4A)。而且,西妥昔单抗处理降低了Nrf2和HO-1的表达,而SB202190降低了西妥昔单抗介导的Nrf2和HO-1的抑制(图4A)。此外,RSL3和西妥昔单抗诱导的HCT116和DLD-1细胞的死亡被SB202190部分挽救(图4B)。而且,Nrf2过表达或HO-1过表达逆转了西妥昔单抗和RSL3联合处理对CRC细胞的存活率的抑制(图4D-F)。此外,t-BHQ处理激活Nrf2或hemin处理激活HO-1部分逆转了RSL3和西妥昔单抗处理对HCT116和DLD-1细胞的生长抑制(图4G, H)。这些结果表明p38 MAPK参与调控Nrf2和HO-1的表达,西妥昔单抗可以通过p38 MAPK的激活抑制Nrf2/HO-1通路。

图4 西妥昔单抗激活p38 MAPK并调节Nrf2/HO-1轴

5. 在异种移植裸鼠模型中,西妥昔单抗通过抑制KRAS突变CRC细胞中的Nrf2/HO-1轴来增强RSL3诱导的铁死亡

在DLD-1异种移植裸鼠模型中,RSL3单独和西妥昔单抗和RSL3联合治疗均可导致肿瘤大小的减小,并且在两种药物联合治疗组中肿瘤大小的减小幅度最大(图5B-D)。对照组和处理组的体重和每日摄食量没有显著变化(图5E)。然后我们测试西妥昔单抗和RSL3联合治疗是否能在体内调节脂质过氧化。值得注意的是,联合组MDA浓度水平显著提高(图5F)。Western blot结果显示, RSL3和西妥昔单抗共同处理后,Nrf2和HO-1的相对水平降低,keap1的表达相对增加(图6A)。免疫组化染色同样证实、RSL3和西妥昔单抗共同处理后,Ki67、Nrf2和HO-1低表达,keap1高表达(图6B)。这些体内结果证实,西妥昔单抗通过抑制Nrf2/HO-1活化来增强RSL3诱导的铁死亡。

图5 西妥昔单抗在体内增强了RSL3和RSL3诱导的ferroptosis的抑制作用

图6 西妥昔单抗通过抑制Nrf2/HO-1轴在体内增强RSL3诱导的铁死亡

以上就是本研究的主要内容啦,研究逻辑比较清晰,实验方法比较常规,易复现。希望这个研究思路能够给你带来一些灵感,说不定还能适当的运用到标书设计中呢,如果觉得这个思路对你有所帮助,请转发点赞哦。

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