文献分享 | 我国首次产OXA-48肠杆菌分子特征系统研究

近期,解放军总医院第一医学中心检验科微生物团队完成了我国分离的产OXA-48肠杆菌的分子特征系统研究。

原文地址:https://doi.org/10.1016/j.jgar.2021.07.006

OXA-48肠杆菌在欧美广泛流行。在一些国家(如西班牙、土耳其等)甚至已成为流行最为广泛的CRE种类。由于OXA-48对碳青霉烯类药物的水解能力较弱,产OXA-48菌株常表现为对这些药物有一定程度的敏感性。因此,即便此类菌株已广泛流行,但任然难以被监测体系发现。此特征值得业界加以重视。    

在我国,产OXA-48肠杆菌仅有散发报道。我们曾报道过一次发生在2014年前后的爆发流行,波及我院的几个临床科室,之后便几乎销声匿迹(见下图)。

 近年来,我们开展了CRE全国范围的监测。结果表明,产OXA-48肠杆菌依然表现为散发流行。然而,通过深入的分子流行病学和分子特征分析,我国产OXA-48肠杆菌有着独特的流行和进化规律。特别是,携带OXA-48编码基因的质粒与产KPC的高危克隆ST11有融合进化的趋势。十分值得警惕!

在种类上,我国产OXA-48肠杆菌已波及主要的肠杆菌种类,以及常见菌种的主要流行克隆(见下图)。

我国产OXA-48肠杆菌依然以肺炎克雷伯菌为主。其中,在我院依然呈现出局部小规模流行的特征。值得警惕的是,出现了产OXA-48和KPC-2的肺炎克雷伯菌ST11,且有的克隆(C型)与我国台湾地区已广泛流行的肺炎克雷伯菌ST11(KPC160111)高度同源(见下图)。

对产OXA-48和KPC-2的肺炎克雷伯菌ST11与单产KPC-2的菌株比较分析表明,肺炎克雷伯菌ST11很可能是先获得KPC-2,而后获得OXA-48的编码基因(见下图)。

通过对携带OXA-48编码基因质粒的分析,OXA-48编码基因均位于大小为63.58~109.14 kb的IncL型质粒上。其中,一株携带109.14 kb质粒的ST11菌株,虽然SNP分析与我国台湾地区分离的菌株高度同源,但质粒却完全不同。序列分析表明,该109.14 kb质粒是在传播过程中整合了该菌株同时携带的一个较小质粒的部分序列,进而成为目前的序列特征。

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