近年来，随着各种质谱仪、流式细胞仪和激光扫描共聚焦显微镜的应用和推广，荧光标记生物大分子药物的检测过程更加简化，检测结果更加准确。与同位素标记检测相比，荧光标记法在生物大分子药物检测中的应用在很大程度上保证了检测过程的安全性和稳定性。
一种荧光标记用于检测多糖。由于多糖的组成和结构复杂，很难对这些药物进行分析和检测，该领域的研究还相对薄弱。
采用两种荧光标记技术检测蛋白质类药物。蛋白质类药物含有大量蛋白质，而蛋白质本身由多种氨基酸组成。其空间结构复杂。它的检测容易受到各种因素的干扰。利用荧光标记技术可以简单有效地对蛋白质类药物进行定量分析。
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记妥布霉素
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记聚甘谷糖醛酸
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记三磷酸腺苷（ATP）
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记紫杉醇PTX
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记顺铂Cisplatin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记阿霉素DOX
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记喜树碱CPT
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记氟尿嘧啶
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记去甲肾上腺素Norepinephrine
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记多巴胺 CY3-Dopamine
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记莱克多巴胺RAC
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记血管内皮抑素Endostatin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记抗肿瘤药物藤黄酸Gambogic acid
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记胰岛素Insulin(Ins)
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记利妥昔单抗rituximab,Rit
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记环孢霉素Cyclosporin-A
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记更昔洛韦Ganciclovir
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记修饰替尼泊苷Teniposide
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记鬼臼噻吩甙
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记依托泊甘Etoposide
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记曲克芦丁Troxerutin
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记酵母微囊
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记治疗性多肽药物MMI-0100
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记抗肿瘤药物rhCNB
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记心得安
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记普萘洛尔
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记的帕西瑞肽
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记万古霉素Vanco
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记环孢菌素A CsA
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记莫西沙星
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记利多卡因
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记茶多酚
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记罗红霉素
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记厄洛替尼
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记多柔比星Doxorubicin,DOX
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记维生素B12
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记胆固醇基普鲁兰药物
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记头孢氨苄CEX
FITC/TMR/RB/Cy3荧光标记头孢羟氨苄CDX
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