大家好，欢迎观看《时空日报》第230期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、淋巴组织中驱动I型和II型体液反应的特化Tfh细胞亚群
Specialized Tfh cell subsets driving type-1 and type-2 humoral responses in lymphoid tissue
Cell Discovery; IF:33.500; DOI: 10.1038/s41421-024-00681-0
内容概要：
① 体液免疫在抵抗感染、维护机体内稳态中发挥着至关重要的作用。其中，T滤泡辅助细胞（Tfh）在支持B细胞激活、促进生发中心（GC）反应和抗体产生等方面扮演着核心角色。研究发现，在感染或免疫过程中，不同的炎症信号可以将T细胞极化为适当的效应表型，如Th1和Th2细胞，它们与体液免疫的极化紧密相关。然而，Tfh细胞具有独特的功能，能够进入B细胞滤泡，并为B细胞提供帮助。近年来，研究人员对在I型和II型条件下诱导的Tfh细胞的特化现象产生了浓厚兴趣。
② 本研究通过在小鼠模型中转移TCR转基因T细胞，并结合机器学习的方法，成功区分了在I型和II型反应中极化的Tfh细胞，即Tfh1和Tfh2细胞。这两种细胞在基因表达上显示出独特的特征，并通过淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）或蠕虫感染诱导的Tfh细胞数据集得到了验证。此外，利用单细胞和空间转录组数据集，研究还揭示了两种免疫条件下Tfh细胞的异质性和定位。特别地，研究发现了一种特定于I型条件的Gzmk+ Tfh细胞群，并在人类个体中识别出了表达Gzmk的CMV特异性Tfh细胞。
③ 本研究不仅揭示了Tfh细胞在不同类型免疫反应下的特化现象，而且为理解体液免疫的复杂机制提供了新的视角。特别是，Tfh1和Tfh2细胞的发现，为开发针对特定疾病的新型免疫疗法或疫苗策略提供了理论基础和实验依据。此外，Gzmk+Tfh细胞的识别为人类疾病的诊断和治疗提供了新的潜在靶点。未来，随着对Tfh细胞功能的深入研究，其在免疫治疗领域的应用前景将更加广阔。
其他研究：T滤泡辅助细胞，体液免疫，免疫反应，机器学习，基因表达特征，空间转录组，scRNA-seq; Kumar S, Basto AP, Ribeiro F, et al.; Instituto de Medicina Molecular, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, Lisboa, Portugal.;Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal.
2、炎性肌病的细胞类型图谱揭示了包涵体肌炎中肌纤维的选择性脆弱性
Cell type mapping of inflammatory muscle diseases highlights selective myofiber vulnerability in inclusion body myositis
Nature Aging; IF:16.600; DOI: 10.1038/s43587-024-00645-9
内容概要：
① 包涵体肌炎（IBM）是老年人群中最为普遍的炎性肌病，具有慢性病程，且目前尚无有效的治疗方法。与其他炎性肌病如亚急性免疫介导性坏死性肌病（IMNM）不同，IBM不仅具有炎性特征，还伴随着退行性病变，这使得其治疗和管理变得更为复杂。尽管研究者们已进行了大量研究，但IBM的致病因素和分子驱动因素在很大程度上仍然未知。
② 为了深入了解IBM的发病机理，本文采用了单核RNA测序和空间转录组学技术，对IBM患者的肌肉活检样本进行了详细的分析，并将其与IMNM肌肉和非炎性骨骼肌样本进行了对比。通过这种方法，绘制了IBM发病机理背后的细胞类型特异性驱动因素图谱。在IBM肌肉中，观察到2型肌核的选择性丧失，这一现象伴随着细胞毒性T细胞和传统型1型树突状细胞水平的显著升高。进一步的研究发现，IBM肌纤维存在细胞应激标志物如GADD45A和NORAD的上调，或者与p62聚集体相关的RNF7等蛋白降解标志物的上调。值得注意的是，GADD45A的上调主要出现在伴有严重组织炎症的2A型肌纤维中。
③ 本研究的结果为理解IBM中肌纤维退化的可能机制提供了重要的见解，并指出了与基因组应激和失神经支配途径相关的2型纤维的选择性脆弱性。这些发现不仅有助于更深入地了解IBM的发病机理，还可能为开发新的治疗方法提供有价值的线索。