大家好,欢迎观看《时空日报》第219期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。
1、接受猪心脏异种移植物的人类死者综合多组学分析
Integrative multi-omics profiling in human decedents receiving pig heart xenografts
Nature Medicine; IF: 82.900; DOI: 10.1038/s41591-024-02972-1
内容概要:
① 在先前的一项研究中,将来自10个基因编辑猪的异种心脏移植到两名人类遗体后,并未出现急性细胞或抗体介导的排斥反应。为了更深入地了解异种移植后的详细分子环境,文章对移植后每6小时从移植遗体获得的血液样本进行了整体和单细胞转录组学、空间转录组学、脂质组学、蛋白质组学和代谢组学分析,同时还进行了组织学和转录组学分析。
② 研究观察到在雄性死者接受异种心脏移植后,外周血单核细胞和移植组织中出现显著早期免疫反应,与T细胞和自然杀伤细胞的活动有关。进一步分析显示存在缺血再灌注损伤,且因T细胞免疫抑制不足而加剧,与先前研究结果一致。移植后42小时,细胞代谢和肝损伤途径发生显著变化,提示广泛的器官功能障碍。而女性死者在此方面的变化较小。
③ 多组学分析揭示了异种移植后不同个体的不同反应,并为治疗提供了新见解,可能有助于开发限制缺血再灌注损伤和改善预后的新方法。
分析工具:心脏异种移植,急性排斥反应,多组学分析,免疫抑制,细胞代谢空间转录组,scRNA-seq; scRNA-seq; Schmauch E, Piening B, Mohebnasab M, et al.; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
2、高级别神经胶质瘤的预后神经表观遗传特征
A prognostic neural epigenetic signature in high-grade glioma
Nature Medicine; IF: 82.900; DOI: 10.1038/s41591-024-02969-w
内容概要:
① 本研究探讨了神经肿瘤相互作用对神经胶质瘤(特别是胶质母细胞瘤)生长的影响,并揭示了神经特征的表观遗传学定义与患者生存的关联。
② 通过多组学分析,包括DNA甲基化、单细胞转录组学以及体外和体内实验,研究发现高级别神经胶质母细胞瘤具有特定的表观遗传学特征和细胞类型,这些特征包括低甲基化CpG位点、与突触整合相关的基因上调以及大量恶性干细胞样细胞的存在。这些细胞与少突胶质细胞和兴奋性神经元有关,并可进一步分类为神经祖细胞群、星形胶质细胞群和少突胶质细胞群。高级别神经特征不仅与体外和体内神经元到神经胶质瘤的突触形成相关,还与异种移植后的不利存活率、总生存率和无进展生存率的降低有关。
③ 此外,高神经肿瘤在脑功能和影像学检查中也显示出异常。
④ 研究强调了在高级别神经胶质瘤中识别和管理高神经特征的重要性,并建议采用最大化的手术切除方法来改善患者的预后。
疾病研究:神经肿瘤,神经胶质瘤,表观遗传学,神经祖细胞,星形胶质细胞,少突胶质细胞,scRNA-seq; Drexler R, Khatri R, Sauvigny T, et al.; Department of Neurosurgery, University Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg, Germany.