大家好，欢迎观看《时空日报》第213期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、单细胞衰老鉴定揭示了衰老异质性、轨迹和调节因素
Single-cell senescence identification reveals senescence heterogeneity, trajectory, and modulators
Cell Metabolism; IF: 29.000; DOI: 10.1016/j.cmet.2024.03.009
内容概要：
① 细胞衰老是多种与年龄相关的病理现象的基础，然而不同类型的细胞在衰老过程中展现出不同的特征，给科学家在研究衰老细胞时带来了显著挑战。为了应对这一挑战，研究人员开发了名为SenCID的机器学习程序，该程序能够从大量和单细胞转录组数据中准确识别衰老细胞。
② SenCID经过了广泛的数据集训练，涵盖了52个衰老转录组数据集中的602个样本和30种细胞类型，并成功鉴定出六种主要的衰老身份（SID）。这些不同的SID在衰老基线、干性、基因功能以及对溶菌的反应等方面表现出不同的特征。SenCID的应用范围广泛，能够重建正常衰老、慢性疾病以及新冠-19病毒影响下的衰老轨迹。此外，当应用于单细胞Perturb-seq数据时，SenCID还有助于揭示衰老调节剂的层次结构，为深入研究衰老调控机制提供了有力工具。
③ 总体而言，SenCID 是关于细胞衰老的单细胞分析的重要工具，能够为科学家提供关于细胞衰老状态的深入理解，并为开发针对衰老细胞的特异性干预策略提供了可能。
疾病研究：计算工具，衰老鉴定，衰老定量，衰老调节器，scRNA-seq；Tao W, Yu Z, Han JJ；北京大学北京-清华生命科学联合中心、高等跨学科研究院、定量生物学中心，北京，中国.
2、全面的单细胞分析揭示了胆囊癌发病过程中其周围环境的动态变化以及关键免疫调节因子——嗅觉素4的作用
Comprehensive single-cell analysis deciphered microenvironmental dynamics and immune regulator olfactomedin 4 in pathogenesis of gallbladder cancer.
Gut; IF: 24.500; DOI: 10.1136/gutjnl-2023-331773
内容概要：
① 本文揭示了胆囊癌(GBC)和良性胆囊疾病的复杂生态系统和分子特征，这对于积极的癌症预防和最佳治疗干预至关重要。
②本研究通过单细胞转录组数据深入分析胆囊癌（GBC）与良性胆囊疾病样本，并结合大规模组织学测定和数字空间分析仪技术，揭示了胆囊疾病在不同病理状态下的免疫微环境变化。研究发现GBC具有抑制性的免疫环境、独特的免疫细胞增殖模式和基质细胞-免疫细胞间的排他性互动。特别发现，GBC进展中基质生态系统的异质性以及嗅觉素4（OLFM4）的升高被识别为疾病进展的关键因素，与免疫逃避和不良预后紧密相关。
③ 这些发现为胆囊疾病的发病机制和GBC的治疗提供了新的见解。