大家好,欢迎观看《时空日报》第201期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。
1、在胶质母细胞瘤中鉴定出的低氧巨噬细胞具有使血管正常化的治疗潜力
Identification of hypoxic macrophages in glioblastoma with therapeutic potential for vasculature normalization
Cancer cell; IF: 50.300; DOI: 10.1016/j.ccell.2024.03.013
内容概要:
① 在胶质母细胞瘤中,单核细胞来源的肿瘤相关巨噬细胞(Mo-TAMs)具有显著异质性。本研究利用单细胞转录组学,对51名IDH野生型或IDH突变型胶质母细胞瘤患者的Mo-TAMs进行了空间转录图谱的绘制,揭示了Mo-TAMs在弥漫性胶质瘤中的空间分布和转录组多样性。
② 研究人员发现Mo-TAMs的一个亚群位于周围坏死的微环境中,受到缺氧信号的影响,形成缺氧亚型(Hypoxia-TAM)。Hypoxia-TAM通过激活肾上腺髓质素分泌信号通路破坏内皮细胞粘附,导致形成高渗透性的血管,阻碍抗肿瘤药物的输送。通过基因消融或药物阻断由Hypoxia-TAM激活的肾上腺髓质素,可以恢复血管的完整性,并提高抗肿瘤药物达拉非尼在瘤内的浓度,实现综合治疗效果。此外,Hypoxia-TAM比例的增加或肾上腺髓质素表达的增加表明肿瘤血管高渗透性和肿瘤不良预后。
③ 该研究的重要意义在于,加深了对Mo-TAMs多样性和TAMs与肿瘤微环境的相互作用的了解,为治疗胶质母细胞瘤的新视角。
疾病研究:胶质母细胞瘤,肿瘤相关巨噬细胞,肾上腺髓质素,血管,转录图谱, scRNA-seq; Wenying Wang, Tianran Li, Yue Cheng, et al. ; 第三军医大学西南医院病理学研究所、西南癌症中心、肿瘤免疫病理学重点实验室,中国.
2、关于人类浆细胞分化的综合染色质和转录组的单细胞分析
Integrative single-cell chromatin and transcriptome analysis of human plasma cell differentiation
Blood; IF: 20.300; DOI: 10.1182/blood.2023023237
内容概要:
① 人类浆细胞(PC)是高度分化的细胞,是B细胞分化的最终阶段。通过体外培养系统,人体浆细胞(PCs)的分化过程已成功复制。本文通过scRNA-seq和单细胞ATAC-seq技术,解密了浆细胞分化的轨迹和机制。
② ScRNA-seq实验揭示了前浆细胞和浆细胞有显著的异质性。通过整合分析单细胞RNA数据和单细胞ATAC数据,发现了几个转录因子,如AP-1转录因子家族的BATF3、FOS和BATF,这些因子可能在浆细胞分化中具有显著阶段特异性。
③ 在单细胞水平上整合转录组和表观遗传数据,分析显示前浆细胞经历了与PC特征相关的表观遗传重塑,同时激活了内质网应激反应(UPR),并致力于分化为PC。研究结果为鉴定早期和成熟浆细胞提供了独特资源,可以更好的理解浆细胞分化的机制,并对涉及浆细胞疾病的治疗提供了思路。