大家好，欢迎观看《时空日报》第193期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、基于单细胞长读测序的映射揭示了发育中及成年小鼠和人类大脑中的特定剪接模式
Single-cell long-read sequencing-based mapping reveals specialized splicing patterns in developing and adult mouse and human brain
Nat Neurosci; IF: 25.000; DOI: 10.1038/s41593-024-01616-4
内容概要：
① RNA的亚型影响细胞的身份和功能，但目前缺少对脑单细胞mRNA亚型的研究，缺乏全面的脑亚型图谱。该研究分析了跨大脑区域、细胞亚型、发育时间点以及跨物种的单细胞RNA亚型。
② 该研究表明，72%的基因全长RNA同源异构体在一个或多个方面上发生了变化，这些变化与细胞类型、发育阶段和物种有关。剪接、转录起始和多聚腺苷酸化位点在细胞类型之间有很大差异，影响蛋白质结构并与疾病相关的变异有联系。
③ 该研究发现，在解剖区域之间，神经递质转运和突触周转基因存在细胞类型的变异性。在小鼠出生后第21到28天的青春期转变期，细胞类型特异性剪接的调节更加显著。同一细胞类型的同源异构体在发育阶段的调节比区域调节更强。很多小鼠中的细胞类型特异性亚型调节与人类海马体中类似，可以应用到人类大脑。相反，人类大脑具有额外的细胞类型特异性，存在增益功能的亚型。该研究绘制了一个详细的单细胞全长亚型调节图谱，跨越发育、解剖区域和物种，揭示了多个维度未被重视的亚型变异程度，对于理解脑功能和疾病具有重要意义。
生长发育；大脑，发育生物学，RNA可变剪接，RNA亚型，scRNA-seq，ScISOr-Seq2; Anoushka Joglekar, Wen Hu, Bei Zhang, et al. ; Weill Cornell Medicine, Worcester Polytechnic Institute, USA.
2、人类卵巢衰老的时空转录组变化及FOXP1的调节作用
Spatiotemporal transcriptomic changes of human ovarian aging and the regulatory role of FOXP1
Nat Aging; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s43587-024-00607-1
内容概要：
① 具有生育和激素分泌功能的卵巢在整个女性生殖生命周期中起着至关重要的作用，卵巢衰老逐渐成为更年期女性的主要健康问题。开发延缓卵巢衰老的治疗策略需要全面了解细胞成分、分子特性及其时空变化。该研究结合scRNA-seq和空间转录组学，系统地表征人类卵巢衰老。
② 该研究分析了八种卵巢细胞类型在衰老过程中表现出的时空分子特征，以及年龄相关的基因表达差异，发现DNA损伤响应可能是卵母细胞衰老的关键生物通路。
③ 该研究鉴定了三种颗粒细胞亚型和五种卵泡膜和基质细胞亚型，以及它们在衰老过程中的时空转录组学变化。研究发现FOXP1是卵巢衰老的调节因子，随着年龄的增长而减少，并抑制CDKN1A的转录。沉默FOXP1可能导致小鼠早期卵巢功能失调。这些发现提供了对人类卵巢衰老时空转录组变化的全面理解，并有助于发现潜在的诊断生物标志物和治疗策略。