通过scRNA-seq绘制细胞间通讯图谱揭示Oprm1是视网膜神经节细胞的神经保护因子

大家好,欢迎观看《时空日报》第174期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。

1、细胞间通讯图谱揭示Oprm1是视网膜神经节细胞的神经保护因子

Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells

Nature Communications; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s41467-024-46428-z

内容概要:

① 以往对神经元存活的研究主要集中在识别控制该过程的内在机制。该研究通过scRNA-seq分析,探讨了细胞间通讯如何对视神经损伤后视网膜神经节细胞(retinal ganglion cell,RGC)的存活做出贡献。

② 研究观察到视网膜细胞在受伤后的转录组变化,其中星形胶质细胞和Müller胶质细胞与RGC的相互作用最多。

③ 通过比较具有不同细胞死亡耐受性的RGC亚型,研究发现高存活率的RGC倾向于与邻近细胞有更多的配体-受体相互作用,并确定了47种在高存活率RGC中更强的相互作用,可能介导神经保护作用。

④ 研究验证了一个确定的靶点,μ-阿片受体(Oprm1),该靶点在三种视网膜损伤模型中具有神经保护作用。虽然内源性Oprm1优先在光敏RGC中表达,但通过pan-RGC过表达Oprm1,其神经保护作用可以转移至其他亚型。最后,调控Oprm1活性可改善小鼠的视觉功能。

生长发育;小鼠,视网膜,神经节细胞,阿片受体,scRNA-seq;Cheng Qian, YingXin, Feng-Quan Zhou, Jiang Qian; Johns Hopkins University School of Medicine; USA.

2、基于鼠狐猴单细胞转录组的全生物体激素信号图谱

An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome

Nature Communications; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s41467-024-46070-9

内容概要:

① 激素可介导细胞远距离通讯,在生理、新陈代谢和健康中发挥重要作用。传统内分泌学家一次只关注一种激素或器官系统。然而,激素信号传导本质上是将不同器官的细胞连接起来,并涉及不同激素的串扰。

② 该研究利用非人灵长类动物——鼠狐猴(Microcebus murinus)的全生物体单细胞转录组图谱,系统地绘制了84种激素的源细胞和靶细胞景观,揭示了以前未表征的激素调节位点,并表明激素信号网络紧密相连、分散且具有丰富的反馈回路。

③ 激素基因及其表达模式的进化比较表明,在基因组和转录组水平上,鼠狐猴比小鼠更好地模拟了人类激素信号传导,并揭示了灵长类动物特异性的激素产生和靶细胞的重新布线。

④ 总之,这项工作补充了经典内分泌研究的规模和分辨率,并揭示了灵长类的激素调节特征。

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