大家好，欢迎观看《时空日报》第173期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、结肠憩室病的基因和转录组景观
Genetic and transcriptomic landscape of colonic diverticulosis
Gut; IF: 24.500; DOI: 10.1136/gutjnl-2023-331267
内容概要：
① 结肠憩室病是老年人中普遍存在的一种疾病，其特征是结肠壁上存在薄壁囊袋，这些囊袋可能会发炎、感染、出血或破裂。该研究对结肠憩室病患者及其对照组的结肠组织进行了DNA和RNA测序，探索了与结肠憩室病相关的转录组变异，并进一步将这种变异与人类肠道的scRNA-seq数据进行了整合。
② 研究发现与结肠憩室病相关的差异表达基因有38个，与转录使用差异相关的基因有17个，表明组织重塑是主要的憩室形成机制。
③ 憩室形成主要与结肠中的基质和上皮细胞相关，包括内皮细胞、肌成纤维细胞、成纤维细胞、杯状细胞、小绒毛、肠上皮细胞、神经元和胶质细胞。
④ 孟德尔随机化突出了五个基因，这些基因可能对结肠憩室病具有潜在的因果效应。值得注意的是，在结肠憩室病例中，ENTPD7的上调得到了确认。此外，结肠憩室病的严重程度与患有结肠憩室炎的遗传易感性呈正相关。
⑤ 总之，研究结果表明，组织重塑是憩室形成的主要机制。具有增加结肠憩室炎遗传易感性的个体在结肠镜检中显示出更多的憩室。
疾病研究；结肠憩室病，组织重塑，憩室形成，遗传易感性，scRNA-seq；Jungkyun Seo, Anne F Peery; The University of North Carolina, The University of North Carolina; USA.
2、小鼠背侧脑桥的单细胞分辨率的空间转录组图谱
A spatially-resolved transcriptional atlas of the murine dorsal pons at single-cell resolution
Nature Communications; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s41467-024-45907-7
内容概要：
① “背侧脑桥”或“背侧脑桥被盖”（dorsal pontine tegmentum，dPnTg）是脑干的一部分。它是一个复杂且神经分布密集的区域，脑桥核参与调节许多重要功能。
② 该研究采用snRNA-seq技术根据其独特的转录组图谱识别了神经元亚型，然后使用MERFISH技术在空间上对这些亚型进行了映射。在dPnTg中获得了约100万个细胞，并定义了120多个神经元亚型的空间分布。
③ 发现了这个区域的无法预测的高转录多样性，并确定了许多神经元亚型的独特标记基因，还证明了许多神经元亚型在人类和小鼠之间转录上的相似性，增强了这项研究的转化价值。
④ 最后，研究开发了一个免费可访问的、GPU和CPU驱动的仪表板（http://harvard.heavy.ai:6273/），将交互式可视化分析和硬件加速SQL结合到数据科学框架中，使科学社区能够查询并获得数据洞察。