大家好，欢迎观看《时空日报》第53期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计5篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、全基因组筛选揭示环磷酸腺苷对终止密码子通读的代谢调控
Genome-wide screening reveals metabolic regulation of stop-codon readthrough by cyclic AMP
Nucleic Acids Research; IF:14.900; DOI: 10.1093/nar/gkad725
内容概要：使用高通量荧光检测方法筛选了大肠杆菌敲除库，发现超过20个基因对终止密码子通读至关重要，其中控制代谢的几个基因，包括cyaA和crp，可以增强终止密码子通读。cyaA催化环磷酸腺苷（cyclic AMP，cAMP）的合成。RNA测序、代谢组学和生化分析表明，删除cyaA会影响氨基酸分解和ATP的产生，从而抑制rRNA和tRNA的转录，降低通读率。单细胞分析进一步表明，cAMP是终止密码子通读和rRNA表达异质性的主要驱动因素。
2、一种基于mRNA的广谱疫苗候选物对异型甲型流感病毒具有交叉保护作用
An mRNA-based broad-spectrum vaccine candidate confers cross-protection against heterosubtypic influenza A viruses
Emerging Microbes and Infections; IF:13.200; DOI: 10.1080/22221751.2023.2256422
内容概要：开发了一种基于mRNA的多抗原流感疫苗，通过单细胞转录组分析发现该疫苗在小鼠模型中表现出强大的体液和细胞免疫应答，诱导病毒中和抗体，抗体依赖的细胞毒性效应介导的抗体和交叉反应的CD8+ T细胞免疫应答。该疫苗对H1N1、H3N2和H9N2病毒产生广泛保护作用。
3、scAce：一种自适应的单细胞基因表达数据嵌入和聚类方法
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
Bioinformatics; IF:5.800; DOI: 10.1093/bioinformatics/btad546
内容概要：提出了一种自适应嵌入和聚类方法scAce，用于单细胞基因表达数据的聚类分析。通过对模拟和真实数据集的计算分析，证明了scAce在scRNA-seq数据的聚类分析中优于现有的聚类方法，并实现了更好的聚类准确性和稳健性。
4、Mef2c在皮层神经元中正调控的基因富集于智商和教育程度相关的常见遗传变异
Genes positively regulated by Mef2c in cortical neurons are enriched for common genetic variation associated with IQ and educational attainment
Human Molecular Genetics; IF:3.500; DOI: 10.1093/hmg/ddad142
内容概要：通过基因表达测序，发现Mef2c基因在大脑皮层神经元中调节的基因集合中，含有与智商和教育程度相关的常见遗传变异。这些基因集合中，下调基因的功能主要与腺苷酸酰化酶信号系统有关，该系统已被证明对突触传递、学习和记忆有积极的调节作用。此外，还发现Mef2c直接调节的三个基因CRHR1、RGS6和GABRG3与智商和/或教育程度有显著相关性。
5、单细胞转录组学支持隐蔽物种存在并揭示两种具有大量种群的壳孔虫形态物种中低水平的种群遗传多样性
Single-cell transcriptomics supports presence of cryptic species and reveals low levels of population genetic diversity in two testate amoebae morphospecies with large population sizes
Evolution; IF:3.300; DOI: 10.1093/evolut/qpad158
内容概要：使用单细胞转录组学方法对两种壳形虫形态物种—Hyalosphenia papilio和Hyalosphenia elegans进行研究，发现了隐蔽物种的存在，这些物种的种群遗传多样性水平较低，表明其有效种群大小较小，可能是由灭绝，重新定居以及有效的扩散方式所致。该发现对于理解非模式微型真核生物的隐蔽物种具有重要意义。
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