GraphPad Prism学术图表

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系统介绍Graphpad Prism 9软件的使用方法

 讲述超过50种学术图表的绘制方法

 提供59个绘图源文件下载

 全面展现学术图表的绘制和美化过程

内容简介

本书主要介绍基于GraphPad Prism 9 的学术图表绘制方法。本书以软件所定义的8 种数据表为纲,按照“数据录入—数据分析—图表生成与美化”的顺序,结合科研实例,使用t 检验、方差分析、生存分析和主成分分析等相关统计分析方法,介绍了散点图、气泡图、柱状图、线图、饼图、面积图等常见学术图表的绘制和美化方法。同时本书提炼了学术图表绘制的一般流程、配色方法及GraphPad Prism 绘图的进阶技巧,兼顾学术图表绘制的实用性和美观性,适用于需要绘制学术图表的高校学生和科研人员。

作者简介

张敏,生物学博士,公众号“如图所示”主创。拥有多年科研绘图经验,录制有《PPT科研作图》《零基础玩转Illustrator科研绘图》《Photoshop科研位图全攻略》和《实用SCI论文图表绘制》等网络课程,翻译有Adobe官方教程《Adobe Illustrator CC2019经典教程》。

目录

第1 章 GraphPad Prism 快速入门 1
1.1 GraphPad Prism 简介 1
1.2 GraphPad Prism 下载和安装 2
1.3 GraphPad Prism 使用界面介绍 3
1.3.1 欢迎界面 3
1.3.2 操作界面 6
1.4 GraphPad Prism 图形修饰和美化 17
1.4.1 图形绘制区的修饰和美化 18
1.4.2 坐标轴区的修饰和美化 23
1.5 学术图表配色知识 . 29
1.5.1 色彩三要素 30
1.5.2 色轮和色轮配色方法 32
1.5.3 色轮配色工具 36
1.6 GraphPad Prism 图片导出和发送 41
1.6.1 图片导出 41
1.6.2 图片发送 43
1.7 GraphPad Prism 一般操作流程 44
第2 章 GraphPad Prism 图表与常见统计方法选择 45
2.1 图表分类及选择 . 45
2.1.1 按照图表外观分类 45
2.1.2 按照图表展示的数据关系分类 47
2.1.3 GraphPad Prism 自定义的8 种数据表 . 48
2.2 常见统计分析方法 . 51
第3 章 XY 表及其图形绘制 . 60
3.1 XY 表及其输入界面 . 60
3.1.1 XY 表输入界面 60
3.1.2 XY 表统计分析方法 63
3.1.3 XY 表下可绘制图形 64
3.2 XY 表常见图形绘制 . 65
3.2.1 散点图 65
3.2.2 象限散点图 71
3.2.3 火山图 74
3.2.4 克利夫兰点图、棒棒糖图 84
3.2.5 模拟直方图 86
3.2.6 线条连接的散点图 88
3.2.7 双Y 轴图形 95
3.2.8 折线图和曲线图 100
3.2.9 图形平移:瀑布图 104
3.2.10 坐标轴平移和波动中心轴设置 106
3.2.11 非连续X 值绘图 109
3.2.12 面积图 110
3.3 带统计分析的XY 表图形绘制 114
3.3.1 相关分析 115
3.3.2 简单线性回归 118
3.3.3 非线性回归 123
3.3.4 带置信条带的散点图 132
第4 章 纵列表(Column)及其图形绘制 . 135
4.1 纵列表及其输入界面 . 135
4.1.1 纵列表输入界面 135
4.1.2 纵列表统计分析方法 137
4.1.3 纵列表下可绘制图形 137
4.2 纵列表常见图形绘制 . 141
4.2.1 简单柱状图/条形图 . 141
4.2.2 截断柱状图 147
4.2.3 直方图 150
4.2.4 手动分组分割 153
4.2.5 悬浮条形图 155
4.2.6 森林图 157
4.3 带统计分析的纵列表图形绘制 . 163
4.3.1 单样本t 检验 . 163
4.3.2 成组t 检验――单数据系列柱状图 . 164
4.3.3 配对t 检验 . 171
4.3.4 普通单因素方差分析 174
4.3.5 随机区组设计单因素方差分析 182
4.3.6 重复测量单因素方差分析 187
4.3.7 ROC 曲线绘制 . 190
4.3.8 Bland-Altman 图 . 196
第5 章 行列分组表(Grouped)及其图形绘制 . 200
5.1 行列分组表及其输入界面 . 200
5.1.1 行列分组表输入界面 200
5.1.2 行列分组表统计分析方法 201
5.1.3 行列分组表下可绘制图形 202
5.2 行列分组表常见图形绘制 . 205
5.2.1 交错和分隔柱状图 205
5.2.2 堆积柱状图 211
5.2.3 双向柱状图 216
5.2.4 叠印柱状图 221
5.2.5 热图 224
5.3 带统计分析的行列分组表图形绘制 . 231
5.3.1 二因素方差分析 231
5.3.2 三因素方差分析 237
第6 章 列联表(Contingency)及其图形绘制 . 238
6.1 列联表及其输入界面 . 238
6.2 带统计分析的列联表图形绘制 . 239
第7 章 生存表(Survival)及生存曲线绘制 . 244
7.1 生存曲线和生存表简介 . 244
7.2 传统K-M 生存曲线绘制 247
7.3 基因表达K-M 生存曲线绘制 251
第8 章 其他数据表及其图形绘制 . 256
8.1 局部整体表(Parts of whole)及其图形绘制 256
8.2 多变量表(Multiple variables)及其图形绘制 260
8.2.1 气泡图绘制 262
8.2.2 主成分分析 265
8.3 嵌套表(Nested)及其图形绘制 270
第9 章 GraphPad Prism 绘图进阶技巧 275
9.1 首选项设置 . 275
9.2 图形组合 . 278
9.2.1 图中图 278
9.2.2 图形堆叠:带箱线图的前后图等 281
9.2.3 图形拼接:边际图 285
9.3 自定义配色方案 . 291
9.4 风格一致快速绘图:魔棒工具和克隆 . 296
9.4.1 魔棒工具 296
9.4.2 克隆和模板 300
参考文献 . 304

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前言/序言

作为一款专业的数据处理和绘图软件,GraphPad Prism 以其便捷性和专业性,在学术图表绘制中具有重要地位。但目前在市面上系统介绍GraphPad Prism 绘图的图书难得一见,个别图书也只是对该软件较低版本的一些简单功能进行了介绍。

本书主要介绍基于GraphPad Prism 9 的学术图表绘制方法。首先,介绍了GraphPad Prism图形生成和美化流程、学术图表配色原则和技巧、常用学术图表类型和软件内嵌的大部分统计方法的选择等内容;然后,着重以软件所定义的8 种数据表为纲,按照“数据录入—数据分析—图表生成与美化”的顺序,结合科研实例,使用t 检验、方差分析、生存分析和主成分分析等相关统计分析方法,介绍了散点图、气泡图、柱状图、线图、饼图、面积图等常见学术图表的绘制和美化方法;最后,介绍了软件的进阶使用技巧。同时本书提炼了学术图表绘制的一般流程、配色方法及GraphPad Prism 绘图的进阶技巧,兼顾学术图表绘制的实用性和美观性。通过对GraphPad Prism 进行系统的介绍,可以让读者全面掌握该软件的使用方法。

本书定位

本书适合于需要绘制学术图表的高校学生和科研人员,并且使用人员不需要具有GraphPad Prism 使用基础,只需要具备基本的计算机知识即可。因此,本书通常可以作为读者的工具书,可使其“依葫芦画瓢”地绘制所需要的学术图表。但在涉及统计分析时,读者需要结合自己的专业知识背景和统计学知识进行判断。

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