ABclonal先前推出的杂交捕获体系1.0版本，自从上线后，获得了客户的一致好评。
现在，经过ABclonal人员的潜心研发，我们正式推出杂交捕获试剂盒2.0版本！新版本试剂盒较1.0版本有哪些进步呢？让我们来一起了解吧~
01
核心数据指标优异
单杂 vs 多杂使用Human Blood gDNA进行基因组建库后，分别采用1-plex、6-plex、12-plex的混样方式进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，探针大小为118 kb，杂交时间为16 h，测序平台为Illumina。
数据显示，1-plex、6-plex、12-plex的捕获中靶率（Target Rate）在73% ~ 75%之间，重复率（Duplication）在35% ~ 37%之间。
每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度（Mean Depth/ 0.5 GB）均在1200x左右，0.2倍平均覆盖深度的占比（0.2 Mean）均高于97%。
除此之外，ABclonal杂交捕获试剂2.0的比对率（Mapping Rate）均在99.9%以上。ABclonal杂交捕获试剂2.0可以在多杂的情况下保证完美的捕获效率和捕获均一性，可有效减少试剂成本，节省操作时间。
图1. ABclonal杂交捕获试剂2.0的1-plex、6-plex、12-plex捕获性能展示（panel size = 118 kb）
快速杂交 vs 过夜杂交
使用Human Blood gDNA进行基因组建库后，采用6-plex混样方式进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，探针大小为118 kb，杂交时间分别设置为0.5 h、1 h、2 h、4 h、16 h，测序平台为Illumina。
数据显示，杂交时间在4 h以下，文库的捕获中靶率（Target Rate）和0.2倍平均覆盖深度的占比（0.2 Mean）均有有一定程度的下降，但Target Rate均在68%以上，0.2 Mean均在95%以上；
杂交时间在4 h或 4 h以上，文库的捕获中靶率（Target Rate）与16 h过夜杂交趋近一致，0.2 Mean在96%以上。如需使用ABclonal杂交捕获试剂2.0进行快速杂交，推荐杂交时间在4 h及4 h以上。
图2. ABclonal杂交捕获试剂快速杂交模式与过夜杂交模式在捕获性能上的对比（panel size = 118 kb）
小Panel vs 大Panel
使用Human Blood gDNA进行基因组建库后，采用6-plex混样方式，每个文库投入量为500 ng，杂交时间设置为16 h，分别使用大小为118 kb和2213 Kb探针panel进行杂交捕获，测序平台为Illumina。
数据显示，Panel-1（size = 118 kb）的捕获中靶率（Target Rate）平均为75%，Panel-2（size = 2213 kb）捕获中靶率（Target Rate）平均为82%；
重复率（Duplication）方面，Panel-1为35%，Panel-2为25%。0.2倍平均覆盖深度的占比（0.2 Mean），Panel-1和Panel-2均为98%左右。综合以上，ABclonal杂交捕获试剂2.0对于大小Panel均能进行高效捕获。
图3. ABclonal杂交捕获试剂对不同大小Panel的捕获性能对比
ABclonal vs 市面竞品
使用Human Blood gDNA进行基因组建库后，分别使用ABclonal杂交捕获试剂2.0、同类竞品I*、同类竞品B*进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，混样方式为6-plex，探针大小为118 kb，杂交时间为16 h，测序平台为Illumina。
数据显示，ABclonal杂交捕获试剂2.0、同类竞品I*、同类竞品B*的捕获中靶率（Target Rate）均在70%以上，重复率（Duplication）接近35%。
每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度均在1200x左右，0.2倍平均覆盖深度的占比均高于97%。综合数据进行比较，ABclonal杂交捕获试剂2.0的捕获性能与同类竞品I*持平，略高于同类竞品B*。
图4. ABclonal杂交捕获试剂2.0与同类竞品I*、同类竞品B*的捕获性能对比
FFPE样本捕获
FFPE样本因其可以室温长时间保存，易于运输等特点，已成为病理组织样本最常用的储存方式之一。全球约有2~4亿的FFPE组织样本，是疾病诊断和科学研究最为宝贵的生物学资源之一。
目前，大部分保存的肿瘤组织为FFPE样本。ABclonal杂交捕获试剂2.0在FFPE样本中的表现如何呢？
使用FFPE DNA进行基因组建库后，分别使用ABclonal杂交捕获试剂2.0、同类竞品I*进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，混样方式为6-plex，探针大小为118 kb，杂交时间为16 h，测序平台为Illumina。
数据显示，ABclonal杂交捕获试剂2.0与同类竞品I*相比，平均捕获中靶率（Target Rate）为81%，略高于竞品I*的80%；重复率（Duplication）为35%，稍高于竞品的29%；0.2倍平均覆盖深度的占比均高于97%。
综合考虑，ABclonal杂交捕获试剂2.0的捕获性能在FFPE样本中的捕获效率与同类竞品I*保持在相同水平。
图5. ABclonal杂交捕获试剂2.0在FFPE样本中的捕获性能展示
02
新增MGI平台封闭试剂
ABclonal杂交捕获试剂2.0新增MGI测序平台单端Index文库Blocker和双端Index文库Blocker，可丰富客户测序选择，帮助客户面对测序场景的多样性。
MGI单端Index文库捕获性能使用Human Blood gDNA进行基因组建库，选择MGI单端Index文库构建方式，并分别采用1-plex、4-plex、8-plex的混样方式进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，探针大小为118 kb，杂交时间为16 h，测序平台为MGI。
数据显示，MGI单端Index文库采用1-plex、4-plex、8-plex的捕获中靶率（Target Rate）在71% ~ 74%之间，重复率（Duplication）在11% ~ 18%之间。
8-plex每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度（Mean Depth/ 0.5 GB）均在1300x以上，1-plex、4-plex每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度均在1500x以上。
0.2倍平均覆盖深度的占比（0.2 Mean）均高于99%；比对率（Mapping Rate）均在99.9%以上。数据证明ABclonal杂交捕获试剂2.0可对MGI单端Index文库进行高效捕获。
图6. ABclonal杂交捕获试剂2.0在MGI单端Index文库中的捕获性能展示
MGI双端Index文库捕获性能
使用Human Blood gDNA进行基因组建库，选择MGI双端Index文库构建方式，并分别采用1-plex、4-plex、8-plex的混样方式进行杂交捕获，每个文库投入量为500 ng，探针大小为118 kb，杂交时间为16 h，测序平台为MGI。
数据显示，MGI单端Index文库采用1-plex、4-plex、8-plex的捕获中靶率（Target Rate）在73% ~ 74%之间，重复率（Duplication）在11% ~ 13%之间。8-plex每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度（Mean Depth/ 0.5 GB）均在1300x以上，1-plex、4-plex每0.5 G测序数据中目的区域的平均测序深度均在1500x左右。
0.2倍平均覆盖深度的占比（0.2 Mean）均高于99%；比对率（Mapping Rate）均在99.9%以上。数据证明ABclonal杂交捕获试剂2.0可对MGI双端Index文库进行高效捕获。
图7. ABclonal杂交捕获试剂2.0在MGI双端Index文库中的捕获性能展示
以上就是ABclonal杂交捕获试剂2.0的部分性能展示，未来我们会持续更新更多的有关杂交捕获的数据，敬请期待！
ABclonal杂交捕获试剂2.0，目前开放beta测试中，想要了解更多信息，获取试用装，请联系销售同事。
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