文献集锦│2021年5、6月单细胞测序高分文献汇总

2021年5、6月份单细胞测序相关文献共收集到104篇(IF>10),文末列表中列出了每篇文献的发表期刊、研究方向和技术平台等信息,接下来先看看其中5篇~

文章展示

01

【标题】组织驻留巨噬细胞为早期NSCLC细胞提供了促肿瘤发生的生态环境

【平台】10x Genomics

【期刊】Nature(IF=49.962)

【时间】2021-06-16

【摘要】巨噬细胞在塑造肿瘤微环境 (TME)、肿瘤免疫和对免疫治疗的反应方面具有关键作用,因此它们成为癌症治疗的重要目标。然而,由于目前我们仍然缺乏对肿瘤巨噬细胞的分子和功能多样性的完整了解,想人为调控巨噬细胞极其困难。巨噬细胞来自两个不同的谱系,一是组织驻留巨噬细胞在局部自我更新,并不依赖于成体的造血过程,而短寿命的单核细胞衍生巨噬细胞来自成人造血干细胞,并在发炎的病变中逐渐积累。这些巨噬细胞谱系如何促进 TME和癌症进展尚不清楚。为了探索人类非小细胞肺癌 (NSCLC) 病变中巨噬细胞的多样性,研究者对肿瘤相关白细胞进行了单细胞RNA测序,发现人和小鼠肺部肿瘤中富含不同的巨噬细胞群。使用谱系追踪,研究者发现这些巨噬细胞群的起源不同,并且在TME 中具有明显的时空分布。在肿瘤形成早期,组织驻留巨噬细胞在靠近肿瘤细胞处积累,以促进肿瘤细胞的上皮-间充质转化,并具有一定的侵袭性,它们还诱导有效的调节性 T 细胞反应,保护肿瘤细胞免受适应性免疫的影响。组织驻留巨噬细胞的消耗使调节性 T 细胞的数量减少,促进了 CD8+ T 细胞的积累,从而降低了肿瘤的侵袭和生长能力。在肿瘤生长过程中,组织驻留巨噬细胞在 TME 的外围重新分布,在小鼠和人类 NSCLC 中,TME 的外围主要由单核细胞衍生的巨噬细胞主导。该研究确定了组织驻留巨噬细胞在早期肺癌发生过程中的贡献,同时还建立了其作为一种新型靶标帮助开发早期肺癌的新型预防和治疗性手段。

02

【标题】人类纹状体发育的编码和长非编码RNA单细胞图谱

【平台】10x Genomics

【期刊】Science(IF=47.728)

【时间】2021-05-07

【摘要】纹状体(striatum)调节着人类社会行为的不同特征,也是在许多神经系统疾病中受到影响的区域,因此破译人类纹状体的发育方式对于了解影响该区域的疾病十分重要。研究人员通过denovo测序完成了1116个长基因间非编码RNA(lincRNA)的目录,然后从早期人类胎儿纹状体分析了96789个单细胞。研究人员发现,D1和D2中型棘突神经元(D1-和D2-MSNs)来自一个共同的祖细胞,并且在有丝分裂后的过渡过程中,谱系得以建立。然后,研究人员发现了通过计算机干扰验证的特定于细胞类型的基因调控网络。此外研究人员还鉴定了人类特异性的lincRNA,它们在人类中促进了该结构的系统发育差异。这项工作为我们详细描绘了控制MSN谱系建立的细胞层级。

03

【标题】对跨同型皮质和海马形成的转录组细胞类型分类

【平台】10x Genomics

【期刊】Cell(IF=41.582)

【时间】2021-05-17

【摘要】哺乳动物大脑中的同型皮质和海马形成(HPF)在感知、认知、情绪和学习中起着关键作用。本文分析了覆盖整个成年小鼠同型皮质和HPF的约 130 万个细胞,从而揭示了谷氨酸能和GABA能神经元类型的完整组成。与传统HPF具有简单细胞组织的观点相反,研究人员发现HPF中的一整套谷氨酸能类型与在六层同形皮质中发现的所有主要亚类同源,表明HPF和同型皮质具有相同的回路组织。研究人员还确定了沿同型皮质深度、整个同型皮质表层以及海马和下丘脑多个维度细胞类型的大规模连续和分级变化。这项研究建立了哺乳动物同型皮质和海马结构的分子结构,并开始阐明其与同型皮质和海马形成两个大脑结构的发育、进化、连通性和功能的潜在关系。

04

【标题】癌细胞和免疫细胞之间的相互作用推动胶质母细胞瘤向间充质样状态转变

【平台】10x Genomics

【期刊】CANCER CELL(IF=31.743)

【时间】2021-06-03

【摘要】胶质母细胞瘤的间充质亚型被认为是由癌细胞内在改变和外在细胞相互作用决定的,但具体机制仍知之甚少。本文通过人类肿瘤和模型系统的单细胞 RNA 测序分析结合功能实验来剖析胶质母细胞瘤与微环境的相互作用。研究结果证明巨噬细胞诱导胶质母细胞瘤细胞转变为间充质样(MES 样)状态。体外和体内实验均显示,该现象由巨噬细胞衍生的制瘤素 M (OSM) 介导,OSM 与其受体(OSMR 或 LIFR)相互作用,并与胶质母细胞瘤细胞上的 GP130 复合,激活 STAT3。此外,本文研究该发现,MES 样胶质母细胞瘤状态也与巨噬细胞中间充质程序的表达增加和 T 细胞的细胞毒性增加有关,这突出了免疫微环境的广泛改变并具有潜在的治疗意义。

05

【标题】神经降压素是一种由淋巴管内皮细胞产生的抗生热肽

【平台】Drop-seq

【期刊】Cell Metabolism(IF=27.287)

【时间】2021-05-25

【摘要】淋巴管系统在其所在器官的生理学中发挥着重要作用,但目前对其明确的作用机制仍缺乏了解。在本文中,研究者对人和小鼠脂肪组织进行了单细胞转录分析,发现淋巴管内皮细胞高度表达神经降压素 (NTS/Nts)。寒冷和去甲肾上腺素以α-肾上腺素依赖性方式降低Nts表达,这提示其在脂肪产热中的作用。NTS对棕色脂肪组织外植体的处理降低了产热基因的表达,进一步证实了该结论。此外,腺病毒介导的过表达和体内NTS的敲低或敲除分别降低和增强了耐寒性,这是由NTSR2和ERK信号传导介导的。抑制NTSR2可以促进肥胖小鼠的能量消耗并改善其代谢功能。这些数据在脂肪组织淋巴管和脂肪细胞之间建立了联系,并具有潜在的治疗意义。

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