大家还记得之前讲的免疫浸润工具大聚汇么（需要的请留言小编会再告知获取渠道），是的，小编如约而至啦~今天给大家介绍的新工具相信大家都很眼熟吧，但是它和GEPIA还是不一样。GEPIA目前综合分析TCGA和GTEx数据最好的平台，目前已经更新到2.0版本。前一段时间GEPIA的团队发表了一个对免疫细胞进行相关分析的数据库—GEPIA2021(http://gepia2021.cancer-pku.cn/)，GEPIA 2021的功能主要包括：细胞比例分析、关联分析、亚表达分析、生存分析，接下来小编就来给大家具体介绍一下。
GEPIA2021的首页长这样：
数据库具体使用
1. 免疫细胞比例分析
在这个部分，我们可以分析不同的组织当中免疫细胞比例。我们需要做的就是选择想要分析的组织已经想要分子的免疫细胞即可。
例如我们想要分析在膀胱癌当中基于CIBERSORT算法得到的两种B细胞的变化。
在选择好之后，点击plot即可得到相关的结果。
结果主要包括两个部分，一个是相同的组织当中免疫细胞比例是否存在差别。另外一个是在相同的免疫细胞在不同的组织当中是否存在差别
2.相关分析
在相关分析当中，主要用来分析组织当中候选免疫细胞是否有区别。在这个部分，如果选择多种组织的话，也是把这些组织的表达水平融合到一起分析的。
这一部分的结果主要是通过散点图来进行呈现的。同时对于不同的组织使用不同的颜色进行区分。同时在结果当中给出了相关分析的相关系数。
3. 基因表达亚组分析
分析基因在不同组织以及不同细胞之间的某一个表达情况。主要也是通过选择想要分析的组织；想要分析的免疫细胞，同时输入想要分析的基因即可。
在这个过程当中，研发团队通过数据的转换。计算了候选基因和免疫细胞之间的关系。这样就可以观察在不同的免疫细胞当中基因的表达情况了。
我们点击 Plot 之后。就可以得到相关在不同组织当中不同免疫细胞当中基因的表达情况。以及在不同的免疫细胞分组当中不同组织内基因的表达情况。
4.生存分析
分析免疫细胞在不同肿瘤当中对预后是否有影响。主要的分析方法是通过KM的算法进行分析的。在这个数据库当中，除了以上的基本选择，还可以选择进行cutoff的比例(默认的是使用中位值进行cutoff选择的)。
预后分析的结果是通过生存曲线图来进行展示的。同时里面也包括了预后分析的P值。
另外需要注意的是，对于免疫细胞的选择，如果选择两个以上的细胞，不是对这两个免疫细胞分别进行预后分析。而是来分析这些免疫细胞整体是否影响预后。对于其免疫评分是通过相加融合到一起的。
对了，需要注意的是：在GEPIA2021当中，免疫细胞的选择不能超过四个哈。要过了就不能分析了。
到这里关于GEPIA 2021的主要功能就介绍完了，我们可以发现网站中的比例分析、关联分析、生存分析等功能简单有效，操作流程非常简单，就算是不用懂代码的小伙伴也可以得到像样的分析结果，感兴趣的小伙伴赶紧去探索下吧。
另外小编还准备了很多其他免疫浸润工具的教程，比如cirbersort，TIMER，ssGSEA，XCell等等，等等。 我们汇总过所有目前较常使用的全部免疫浸润工具，感兴趣的小伙伴添加签名栏宫主号获取。小编等你们哟~