文件速递1。生命的起源——先是鸡还是先是蛋?

慕尼黑路德维希·马克西米利安大学(Ludwig Maximilians Universitaet,LMU)团队最近发现,运输RNA(tRNA)的微小变化使它们能够组装成功能单元,并以指数方式复制信息。tRNA是早期生命形式进化的关键单位。

我们都知道,生命是基于复杂的相互作用网络,这种网络发生在细胞的微观尺度上,涉及数千种不同的分子。在我们的身体里,每一个基本的反应过程每天都会重复无数次。在复制反应中,蛋白质复制核DNA分子中编码的遗传信息,然后在细胞分裂期间将它们平均分配给两个子细胞。这些信息被选择性地复制(即“转录”)到信使RNA(mRNAs)中,以指导相关细胞所需的各种不同蛋白质的合成。第二种类型的RNA,转运RNA(tRNA),在将mRNA“翻译”为蛋白质方面起着关键作用。转运RNA介导mRNAs和蛋白质之间:它们确保每个特定蛋白质中包含的氨基酸亚基,然后将相应的mRNAs按特定顺序排列在一起。

但是,地球生命系统的早期进化是如何实现DNA复制和mRNAs转化为蛋白质之间的复杂相互作用的呢?这是鸡和蛋问题的一个典型例子:蛋白质是基因信息转录所必需的,但它们的合成本身依赖于转录。

由迪特尔·布劳恩教授领导的LMU团队发现了这个难题是如何解决的。如果对现代tRNA分子结构的进行微小的改变,就能使它们自主地相互作用,形成一种复制模块,并以指数方式复制信息。这一发现意味着tRNAs是现代细胞进行转录和翻译的关键中介,也是早期生命系统中复制和翻译的关键纽带。所以,到底是遗传信息还是蛋白质,哪一个首先出现的这个问题,有了一个简单的解决方法。

值得注意的是,就序列和总体结构而言,tRNAs在所有三种类型的生命都有高度保守,即单细胞的古菌Archaea和细菌Bacteria(无细胞核)和真核生物(有细胞核)。这种高度保守性表明tRNAs是生命系统中最古老的分子之一。

生命进化的后续步骤,复制和翻译的进化,以及它们之间复杂作用关系,十分相似,都不是一步完成的结果。更好的解释是进化过程的顶点。迪特尔·布劳恩教授说:“自我复制、自催化、自组织和自我分隔等基本现象在这些发展过程中发挥了重要作用。”“从更普遍的意义上讲,这种物理和化学过程完全取决于提供非平衡条件的环境的可用性。”

在实验中,使用一组相互互补的DNA链,这些DNA链模仿了现代tRNAs的特征形式。每个互补DNA链由两个“发夹”组成(每条链可以与自身部分配对,形成一个拉长的环状结构,被称为“发夹”),两个“发夹”的中间由一个信息序列隔开。八个互补DNA链链可以通过互补的碱基对相互作用,形成一个复合体。根据中心信息区域指定的配对不同,形成了相当于4位数字的二进制代码。

在复制过程中,互补链与模板链的序列相互配对。随着时间的推移,双链的相邻“发夹”相互匹配成对,形成稳定的骨架结构,而温度波动继续推动复制过程进行。如果温度持续上升一段时间,双链就会从新形成的稳定结构中分开,然后两者都可以在下一轮复制中充当模板链。

以上结果能够证明该系统具有指数复制的能力,这是一个重要的发现。它表明,复制机制对由于错误积累造成的崩溃有很强的抵抗力。事实上,复制复合体本身的结构类似于现代的tRNA,这就表明早期形式的tRNA可能参与了分子复制过程,而tRNA分子在将信使RNA序列转化为蛋白质之前就开始发挥作用,如现代的一样。Alexandra Kühnlein表示:“在早期进化的过程中,复制和翻译之间的这种联系可以为鸡与蛋的问题提供一个答案。” 此研究结果还能补充解释古tRNAs的特征形式,并阐明tRNAs在翻译中的作用。

随着生命起源和达尔文进化论的出现,在实验室水平上进行化学聚合物的研究,对生物技术的未来产生了重大影响。布劳恩教授总结说:“我们对早期分子复制形式的研究,以及我们发现复制和翻译之间的联系,使我们距离重建生命的起源更近了一步。”

Journal Reference:

  1. Alexandra Kühnlein, Simon A Lanzmich, Dieter Braun. tRNA sequences can assemble into a replicator. eLife, 2021; 10 DOI: 10.7554/eLife.63431

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