大家好，欢迎观看《时空日报》第216期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、健康和疾病中的空间转录组学
Spatial transcriptomics in health and disease
Nature Reviews Nephrology; IF: 41.500; DOI: 10.1038/s41581-024-00841-1
内容概要：
① 本文综述了空间转录组学技术的重要性及其在多领域应用中的进展。该技术能精确定位大分子在组织中的位置、结构和细胞类型，为理解器官的细胞和空间组织提供了有力工具。
② 空间分辨转录组技术可在单细胞或接近单细胞分辨率下绘制转录本图谱。该技术不仅应用于临床前模型和人体样本，揭示了新细胞类型的空间信息和邻里细胞间的相互作用，还增进了对损伤反应中变化的理解。
③ 结合其他仿生方法，如蛋白质组学和空间表观遗传学，空间转录组学将进一步推动综合分子图谱的生成，为体内平衡和疾病中分子成分的动态关系提供深刻见解。本文还概述了当前和新兴的空间转录组学方法、应用及面临的挑战。
疾病研究：大分子定位，肾脏病学，蛋白质组学，空间表观遗传学，分子图谱，空间转录组； Jain S, Eadon MT.；Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University School of Medicine, St. Louis, MO, USA.
2、人类神经模型揭示了神经母细胞瘤相关染色体畸变对发育的影响
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
Nature Communications; IF: 16.600; DOI: 10.1038/s41467-024-47945-7
内容概要：
① 儿童早期肿瘤由转化的胚胎细胞产生，这些胚胎细胞通常携带大拷贝数改变(CNA)。然而，由于缺乏合适的模型，目前尚不清楚 CNA 如何促进胚胎肿瘤发生。
② 研究团队采用了女性人类胚胎干细胞（hESC）分化模型，并结合单细胞转录组和表观基因组分析技术，来评估染色体17q/1q增益对肿瘤发生的影响。这种染色体增益在胚胎肿瘤神经母细胞瘤中普遍存在。研究发现，大拷贝数改变（CNA）会损害躯干神经（NC）细胞及其交感肾上腺衍生物（神经母细胞瘤假定的起源细胞）的特异性。更重要的是，当MYCN基因（N-myc基因）过度表达时，这种损害效应会加剧。值得注意的是，MYCN的扩增与神经母细胞瘤中的CNA同时发生。此外，研究还发现CNA能够增强MYCN和突变NC细胞的促致瘤作用，这与肿瘤中神经母细胞瘤细胞的行为相似。这些发现提示CNA和MYCN的异常表达可能在神经母细胞瘤的发展中起到了关键作用。
③ 这项研究为理解CNA驱动的胚胎肿瘤启动提供了机制框架。
疾病研究：儿童早期肿瘤，转化的胚胎细胞，表观基因组分析，女性人类胚胎干细胞，scRNA-seq; Saldana-Guerrero IM, Montano-Gutierrez LF, Boswell K, et al.; Centre for Stem Cell Biology, School of Biosciences, The University of Sheffield, Sheffield, UK.