时空日报 | Nature cancer:“PERCEPTION”利用单细胞转录组预测肿瘤患者对治疗的反应

大家好,欢迎观看《时空日报》第202期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。

1、“PERCEPTION”利用单细胞转录组预测肿瘤患者对治疗的反应和排斥

PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors

Nature cancer; IF: 22.700; DOI: 10.1038/s43018-024-00756-7

内容概要:

① 为了个性化的为癌症患者提供最佳治疗方案,本文作者开发了一个名为“PERCEPTION”的精准肿瘤学预测工具。“PERCEPTION”在预测培养的和患者肿瘤源性原代细胞对靶向治疗的反应,以及在多发性骨髓瘤和乳腺癌的两个临床试验中显示出成功。它还能捕获接受酪氨酸激酶抑制剂治疗的肺癌患者中的耐药性发展。

② 该研究使用肿瘤单细胞表达谱来分层管理患者,有望推动临床设置中单细胞组学分析的应用,从而增强基于单细胞组学的精准肿瘤学工具的推广使用。

生信工具:肿瘤治疗方案,治疗反应模型,单细胞表达谱, scRNA-seq; Sanju Sinha, Rahulsimham Vegesna; NCI-Designated Cancer Center, Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, San Diego, CA, USA;Cancer Data Science Laboratory, National Cancer Institute, Bethesda, MD, USA.

2、植入脑部的电极周围的结构、功能和遗传变化

Structural, Functional, and Genetic Changes Surrounding Electrodes Implanted in the Brain

Acc Chem Res;IF:18.300; DOI: 10.1021/acs.accounts.4c00057

内容概要:

① 脑部植入电极能够监测和刺激大脑信号,在临床上用于治疗各种神经疾病和损伤。然而,外来物体的植入会导致血管和神经细胞结构破坏、炎症反应和诱导反应性胶质细胞状态。本文对植入电极周围发生的生物学变化进行了深入的研究。

② 通过空间转录组学技术分析植入设备周围的基因表达,发现植入设备与数百个基因的诱导表达有关,这些基因与神经炎症、神经胶质反应、少突胶质细胞功能和细胞代谢有关。不同刺激强度的电信号可以诱导与损伤或重塑有关的基因表达。

③ 该研究结果为改进植入电极的设计提供了科学依据,并为评估植入电极后的生物反应提供了新的标志物,对于提高电极安全性和有效性具有重要意义。

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