大家好,欢迎观看《时空日报》第47期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计7篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。
1、γδ T细胞在慢性布氏锥虫感染期间控制小鼠皮肤炎症和皮下脂肪消耗
γδ T cells control murine skin inflammation and subcutaneous adipose wasting during chronic Trypanosoma brucei infection
Nature Communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40962-y
内容概要:通过空间和单细胞转录组学检测到γδ T细胞的扩增,这些细胞在皮下脂肪组织中产生IL-17A。此外,皮下间质前脂肪细胞通过Cd40和Tnfsf18信号等触发T细胞激活。雌性小鼠缺乏产生IL-17A的Vγ6+ 细胞时,出现非寄生虫负担引起的广泛的炎症和皮下脂肪组织消耗。
2、一种新的分子类别通过将HDAC/MECP2复合物招募到PU.1基序中减少神经炎症
A novel molecular class that recruits HDAC/MECP2 complexes to PU.1 motifs reduces neuroinflammation
Journal of Experimental Medicine; IF:15.300; DOI: 10.1084/jem.20222105
内容概要:通过分析单细胞转录组数据集,发现PU.1结合基序(motifs)在阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)患者的小胶质细胞中富集。此外,A11通过招募MECP2、HDAC1、SIN3A和DNMT3A等抑制性复合物到PU.1 motifs上来调节基因,从而具有抗炎症功效和纳摩尔级别的效力,揭示了一种具有治疗神经退行性疾病潜力的新型抗炎症分子类别。
3、单细胞RNA揭示人类乳腺肿瘤界面区的肿瘤微环境
Single-cell RNA reveals a tumorigenic microenvironment in the interface zone of human breast tumors
Breast Cancer Research: BCR; IF:7.400; DOI: 10.1186/s13058-023-01703-7
内容概要:通过scRNA-seq技术对人类乳腺肿瘤的肿瘤区、正常区和界面区进行分析,发现界面区存在一种独特的肿瘤微环境,包括调节性T细胞、M2巨噬细胞、血管生成相关的肥大细胞、DNA修复能力较弱的干细胞、具有血管生成活性的内皮细胞、合成胶原的成纤维细胞和具有增殖活性的上皮细胞,揭示了不同细胞类型之间的特殊配体-受体对,有助于保护内皮细胞的凋亡并促进上皮细胞的增殖和迁移。
4、早产儿气道的单细胞分析揭示髓系分化的连续性
Single-cell profiling of premature neonate airways reveals a continuum of myeloid differentiation
American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology; IF:6.400; DOI: 10.1165/rcmb.2022-0293OC
内容概要:通过采集新生儿气管内抽吸物获得scRNA-seq数据,发现早产儿气道中主要存在一系列髓样细胞,包括胎儿单核细胞、中间髓样细胞和巨噬细胞。通过轨迹分析,发现这些髓样细胞分化成肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞的过程中存在一个桥梁阶段。这些细胞代表了复杂的肺生物学特性,可用于人类发育和疾病研究。
5、通过Navitoclax/ABT263治疗消除衰老细胞逆转全脑放疗诱导的小鼠血脑屏障破坏
Elimination of senescent cells by treatment with Navitoclax/ABT263 reverses whole brain irradiation-induced blood-brain barrier disruption in the mouse brain
Geroscience; IF:5.600; DOI: 10.1007/s11357-023-00870-x
内容概要:通过双光子显微镜定量评估血脑屏障(blood-brain barrier,BBB)通透性和毛细血管密度,并通过成像流式细胞术、免疫标记和scRNA-seq检测微血管内皮细胞的衰老情况。结果表明,全脑放疗(whole brain irradiation,WBI)诱导内皮细胞衰老,导致BBB慢性破坏和皮层微血管密度下降。使用已知的衰老细胞清除药物Navitoclax/ABT263,可以有效消除WBI诱导的衰老内皮细胞,降低BBB通透性,增加皮层毛细血管密度。
6、基于m7G调节的头颈鳞状细胞癌甲基化模式
A novel m7G regulator-based methylation patterns in head and neck squamous cell carcinoma
Molecular Carcinogenesis; IF:4.600; DOI: 10.1002/mc.23624
内容概要:通过转录组、单细胞序列和空间转录组数据的计算机辅助生物信息学分析,确定了头颈鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)患者中的三种不同的m7G修饰模式,并与不同的临床表现和三种典型的免疫表型相关。建立了一个名为m7Gscore的预测模型,通过LSM1/NUDT5的敲除可以抑制HNSCC细胞的恶性程度,有助于识别更有效的免疫治疗方法,提高HNSCC的临床预后。
7、新生儿胆管结扎小鼠模型的单细胞测序鉴定梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞的异质性
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
Scientific Reports; IF:4.600; DOI: 10.1038/s41598-023-41207-0
内容概要:通过scRNA-seq技术发现新生儿胆管结扎小鼠模型可用于比较不同病因的胆汁淤积中巨噬细胞的极化差异,为研究和开发免疫调节治疗提供了可能。此外,该模型具有较低的死亡率,且与猴病毒诱导的胆道闭锁模型相比,其巨噬细胞具有更高的内吞作用。