大家好，欢迎观看《时空日报》第43期。本期追踪到时空/单细胞组学相关研究文章共计6篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的StereoCopilot模块生成的文章概要，并辅以人工审核，供了解参考。
1、染色体不稳定引起的非细胞自主性癌症进展
Non-cell-autonomous cancer progression from chromosomal instability
Nature; IF:64.800; DOI: 10.1038/s41586-023-06464-z
内容概要：研究了染色体不稳定性（chromosomal instability，CIN）对癌症转移的影响，并发现CIN诱导的cGAS-STING通路的慢性激活促进了癌细胞下游信号重构，导致促转移的肿瘤微环境。通过使用STING抑制剂治疗，可以减少CIN驱动的黑色素瘤、乳腺癌和结直肠癌的转移。这项研究为识别和治疗CIN诱导的炎症引发的肿瘤提供了可行的策略。
2、单细胞转录组分析揭示胰腺癌肝转移中的免疫抑制性肿瘤微环境
Single cell transcriptomic analyses implicate an immunosuppressive tumor microenvironment in pancreatic cancer liver metastasis
Nature Communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40727-7
内容概要：研究了胰腺癌肝转移的单细胞转录组学特征，发现肝转移的肿瘤细胞具有明显的转录组差异，并且在肝转移的微环境中存在特定的亚型的基质和免疫细胞，包括RGS5+ 癌相关成纤维细胞、CCL18+ 脂质相关巨噬细胞、S100A8+ 中性粒细胞和FOXP3+ 调节性T细胞。
3、双调蛋白结合IL1RL1+ 调节性T细胞和癌相关成纤维细胞阻碍抗肿瘤免疫
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
Science Advances; IF:13.600; DOI: 10.1126/sciadv.add7399
内容概要：IL1RL1信号通路在T细胞中抑制了IL-33和PD-1阻断的抗肿瘤活性。通过scRNA-seq和阻断实验，发现AREG-EGFR轴介导了IL1RL1+ 调节性T（regulatory T，Treg）细胞和癌相关成纤维细胞（cancer-associated fibroblasts，CAFs）之间的相互作用。此外，双调蛋白（amphiregulin，AREG）mAbs和IL-33联合抑制了肿瘤生长。该研究揭示了一个以前未知的AREG/EGFR介导的Treg/CAF耦合机制，它控制着成纤维细胞功能状态的分叉，是癌症免疫治疗的关键障碍。
4、原发性干燥综合征中B细胞的多模态单细胞测序
Multi-modal single cell sequencing of B cells in primary Sjögren’s Syndrome
Arthritis and Rheumatology; IF:13.300; DOI: 10.1002/art.42683
内容概要：通过scRNA-seq和scVDJ-seq，发现SSA/SSB自身抗体阳性（SSA/SSB+）的原发性干燥综合征（primary Sjögren’s Syndrome，pSS）患者的幼稚B细胞比例最高，记忆B细胞比例最低，所有B细胞亚型中干扰素诱导基因的上调最为显著。与对照组相比，IGHV1-69和IGHV4-30-4在所有pSS亚组中使用率更高。这些结果为pSS患者的分层提供线索，有助于更好地理解B细胞的内在差异和其对表型和结果的影响。
5、二甲双胍拯救脑室周围异位症患者细胞的迁移缺陷
Metformin rescues migratory deficits of cells derived from patients with periventricular heterotopia
EMBO Molecular Medicine; IF:11.100; DOI: 10.15252/emmm.202216908
内容概要：通过scRNA-seq分析表明，人类神经元祖细胞（human neuronal progenitor cells，hNPCs）的自噬相关基因表达水平相似。二甲双胍通过增强AMPK依赖的自噬，可以促进脑室周围神经元异位症（periventricular neuronal heterotopia，PH）患者的hNPCs的迁移，暗示了在某些形式的PH中调节hNPCs的自噬可能会挽救神经元迁移缺陷。
6、整合基于成像的分类和转录组学并根据人类卵母细胞生殖效率对其进行质量评估
Integrating imaging-based classification and transcriptomics for quality assessment of human oocytes according to their reproductive efficiency
Journal of Assisted Reproduction and Genetics; IF:3.100; DOI: 10.1007/s10815-023-02911-y
内容概要：通过成像和scRNA-seq技术建立了一个排名工具，可以预测受精、囊胚化和着床的成功率。成像参数中的光密度、梯度、反差矩阵熵和结构复杂度等具有最高的预测性能，揭示了低质量卵子的细胞周期受损情况。